“行了，回你的世界去吧，記住了，找到阿繡，帶著她一起過來我才會告訴你媽媽在哪兒。”方城不想再跟這個心如赤子的傢伙交流，心太累，揮了揮手，直接把他送走了。

說起來，石破天的身世其實很可憐，他本是名門大俠之後，因為梅芳姑恨石清移情別戀，繼而搶走剛出生的石中堅（即後來的石破天）。

石破天被帶至熊耳山，經常遭到梅芳姑打罵，梅芳姑叫他做“狗雜種”，他便以為這就是他自己的名字。

石破天從小學會了砍柴、做飯等種種家務，卻大字不識一個，於世事、人心更是一無所知。一天梅芳姑忽然不見了，石破天自小相伴的那條叫“阿黃”的狗也不見了，便出去到處尋找，結果人和狗都沒找著，自己卻迷了路。

當石破天來到一個叫侯監集的小鎮上時，適逢許多武林人物為一枚“玄鐵令”大動干戈，他是個小乞兒的樣子，誰也沒注意，卻因為飢餓太甚，撿了個混戰中撒落在地的燒餅吃，意外地得到了“玄鐵令”。正在眾人現，各各威逼利誘之時，玄鐵令的主人“摩天居士”謝煙客適時趕到，將玄鐵令奪回。

謝煙客怕眾人教唆石破天干不利於他的事，因而將石破天連令帶人一起攜走。因為梅芳姑的教育從不求人，因而謝煙客無論怎麼利誘都無法使石破天求他。

謝煙客無奈只好帶他回自己隱居的摩天崖，途中石破天遇見幾個武林人物圍攻一個叫大悲老人的老頭，便挺身而出，雖然沒救成大悲老人，卻在他臨死之前做了大悲老人的朋友，得了他一套載有武功的泥人。到了摩天崖，謝煙客傳授石破天兩種極陰、極陽的內功，想讓他走火入魔而死，以絕後患。

石破天長到十八九歲時，修煉武功時經脈相互激烈衝撞而至昏迷，恰逢長樂幫眾人誤以為石破天是他們的幫主，將他劫回幫中。

幫中的醫道高手“妙手回春”貝海石將石破天救活，反而成就了他“陰陽合一”的無上內功。

貝海石等人知道“狗雜種”不是真的石破天，但因他長相與石破天酷似，因此故意將錯就錯，讓他冒名頂替，以替他們消解即將到來的災難，貝海石在他昏迷時用手術弄上去肩上的疤痕。

在昏迷時，丁璫偷來“玄冰碧火酒“壓住了他體內陰陽二息的交拚。

在石破天醒來後又練起了泥人上武功而導致內息力道混亂，這時展飛因為石中玉曾調戲其妻子的緣故而對石破天檀中穴出了一掌，也震得石破天吐出丹田內鬱積的毒血，水火既濟，這兩門純陰純陽的內功非但不再損及他身子，反而化成了一門亙古以來從未有的古怪內力，隨後石破天幫助展飛瞞下了罪行，使得侍劍也對他另眼相看。

後獅威堂陳沖之以為得罪石破天並誤以為被下毒，便帶石破天去關押花萬紫的地方，石破天見到後便要求把花萬紫放走。

之後遇上丁璫，並被帶去見丁不三，丁不三得知“玄冰碧火酒“被石破天喝掉，因而威逼石破天與丁璫結婚，在石破天揭開丁璫紅蓋頭時，貝海石相告雪山派的人前來問罪。

石破天便回到長樂幫，見到白萬劍等人，種種誤會之下石破天被白萬劍捉走，後遇到石清、閔柔。

之後石破天被丁璫、丁不三救出，丁不三見其太笨，要求他十天內打敗白萬劍，後來丁璫為了保護石破天將其扔到白阿繡的船上。

丁不四想要史小翠上碧螺島，史小翠要求其傳授石破天武功並打敗石破天才行，但因石破天內功渾厚，丁不四便與石破天一直耗著。快到碧螺島時，史小翠便與阿繡一同跳入江中，石破天為救她們也向江中跳去。

三人被江水衝到了紫煙島，在島上史小翠收石破天為徒，為了勝過雪山派便並讓他改名“史億刀”，隨後傳授“金烏刀法”。

在練武過程中，阿繡為了以後父親的面子，也教了石破天一招“旁敲側擊”。

雪山派白萬劍等人與丁不三、丁不四都來到紫煙島，一言不合下便大打出手，石破天為救白萬劍等人而與其聯手。

隨著眾人離開後，石破天也找不到史小翠、白阿繡，便也乘船離開紫煙島。

後石破天遇上俠客島的賞善罰惡二使張三、李四，並喝了他們的藥酒，並結為兄弟，後來也救了二人性命。

石破天在上清觀遇上了石清、閔柔，為了幫助二人拿到兩塊銅牌誤傷照虛、通虛。後來天虛向石清、閔柔問罪時又使其中毒，誤會澄清後，石破天為三人解毒，並與石清、閔柔離開。

石清、閔柔意識到石破天是被長樂幫用來接”賞善罰惡令“，便一同前往長樂幫，途中石破天遇上丁璫，便被帶走，後遇上丁不四和關東四大門派的人，石破天救了關東的人。

在長樂幫中，張三、李四幫助石破天解開了種種誤會，見到了與自己相貌一樣的“石中玉”，而後石破天仍以幫主的身份接了俠客島的“賞善罰惡令”，石中玉則被石清、閔柔帶去雪山派領罪，後來丁璫為救石中玉，將石破天替換掉了石中玉。

石破天等人趕回雪山派，石破天憑藉自己的蓋世神功消解了雪山派的門戶之變，治好了白自在的瘋病。這時謝煙客在石中玉的唆使下，趕來向雪山派尋仇，但石破天的出現終於使一切真相大白，石破天這時求謝煙客帶走石中玉直到變好為止，而丁璫也徹底棄石破天而去。

不久石破天隨白自在等武林高手持令前往“俠客島”，在島上經歷一番驚險後，終於弄明白了三十年來許多武林高手前往“俠客島”一去不返的真相島上一個山洞裡的石壁上刻著“詩仙”李白的那叫做《俠客行》的五言古詩，其中隱含了一項絕頂神功《太玄經》。

俠客島主從中土以賞善懲惡令逼來眾多武林高乎，只是為了一起參詳這項神功，但各人見仁見智，誰也破解不了，而對武學的酷嗜，卻使這些人面對石壁神智痴迷，再也不想離開這個山洞，石破天聽著眾人的爭論，看著他們痴迷的樣子，只是感到害怕，卻不明所以。

眾人都在詩句分解註釋的各個小山洞，他因為不識字，在那兒既害怕又看不出個究竟來，便來到刻著整篇詩的大洞。不料他往石壁上一看，目中所見都是一把把形態、劍勢、劍意各各不同的利劍，所有的文字於他毫無實際的意義可言，他順著劍勢、劍意看去，內息自然而然隨之流動，手舞足蹈，待得從頭至尾看完一遍，這項《太玄經》神功已是被他練成了。

迴歸中土後，救下了正跳入海中的史小翠、白阿繡，後為解一樁武林疑案，他隨丁璫的叔祖“一日不過四”丁不四等人去尋找他的女兒，終於又回到了小時候居住的荒山。

最終梅芳姑得知石清變情正是自己太過優秀，而後自盡，石破天的身世便再也難明白，到此，全書完。

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